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Notepad++ est un éditeur de source avec mise en relief de la syntaxe et mise en forme de cette dernière. Ce logiciel vous permet également de colorer les mots définis par l'utilisateur. Vous pouvez ainsi imprimer votre code source en couleur. De plus, Notepad++ possède une fonction multi-vues qui permet à l'utilisateur d'éditer différents documents à la fois et même d'éditer le même document en synchronisant 2 vues différentes. Il supporte entièrement le glisser-déposer: vous pouvez déposer le fichier pour l'ouvrir mais également glisser et visionner un document d'une vue à une autre. Enfin, ce logiciel fonctionne aussi vite que le bloc-notes fourni par MS Windows.

Anjuta est un IDE (les fonctionnalités RAD intégrant Glade sont en cour de développement) pour Linux développé dans le cadre du projet Gnome et par conséquent, il est particulièrement intéressant pour les développements en C avec GTK+ (coloration syntaxique des mots clés de GTK+) mais il peut aussi être utilisé pour le développement en C++ avec gtkmm.

jEdit est un éditeur de texte adapté aux développements en tout genre.
En effet, l'application est capable de mettre en évidence le code de plus d'une centaine de langages dont CSS, ASP, HTML, XML, PHP, Perl, JavaScript, AppleScript, ActionScript, C, C++, Java, Objective C, etc. jEdit permet d'annuler ou de refaire un nombre illimité d'actions. Les fonctionnalités du logiciel peuvent être améliorées grâce à l'installation de plugins. jEdit étant développé sur l'ensemble des plateformes, vous pourrez l'utiliser quelque soit votre environnement de travail.

PSPad editor est un freeware permettant d'éditer du texte et du code sous Windows.Cette application comporte des outils nécessaires dans la réalisation de scripts, dans le traitement des lignes, dans les conversions, compilations et compressions, etc. Un éditeur Hexadécimal, un moteur de recherche et des filtres font partie des nombreuses options du programme, ainsi que l'insertion de caractères spéciaux, l'auto-correction, la comparaison de textes ...

Issu du logiciel non libre Komodo IDE, cet environnement de développement intégré contient tout ce que l’on peut attendre d’un environnement de développement.

Critique de JakoJako
Dernière version disponible, j'ai téléchargé la version d'évaluation.
Atouts: interface beaucoup plus intuitive (pour moi) et claire qu'Eclipse qui est une vraie usine à gaz. Notion de projet. Possibilité d'avoir des watch, des breakpoints actifs ou inactifs (qui sont conservés même quand on ferme l'EDI). Affichage sympa avec possibilité d'avoir des lignes verticales pour indiquer les { et } correspondants. Editeur pratique et intuitif. A priori, possibilité de reformatage du t ... Voir la suite

Pour l'analyse de données transcriptomiques, je conseille TigrMeV !!! Pas forcément le plus intuitif au départ, les fichiers doivent être formatés le plus souvent avant import, mais il est quand même bien utile !

BioEdit est un éditeur d'alignement des séquences biologiques écrites pour Windows. Une interface intuitive de documents multiples avec des fonctions pratiques rend l'alignement et la manipulation des séquences relativement facile sur votre ordinateur de bureau.

Qu'en pensez-vous ?

Open Perl IDE est un environnement de développement intégré pour écrire et déboguer des scripts Perl

Padre est un IDE Perl, un environnement de développement intégré, ou en d'autres termes un éditeur de texte qui est simple à utiliser pour les programmeurs Perl, mais aussi de nouveaux supports de grands projets multi-langue et multi-technologies.

Notre principal objectif est de créer un environnement incomparable pour l'apprentissage de Perl et de créer des scripts Perl, les modules et les distributions, avec un système de plug-in extensibles pour soutenir l'ajout de fonctionnalités et les langues et pour soutenir les développeurs avancés, prenant l'éditeur où ils veulent qu'il aille.

Critique djibril :
Padre est un éditeur de texte très ... Voir la suite

KDevelop est un IDE pour Linux qui fait partie de la suite de logiciels proposée par l'environnement de bureau KDE. A l'inverse de Anjuta, il est plutôt axé pour le développement en C++ avec Qt.

SciTE est un éditeur de texte graphique, gratuit et open source fonctionnant sous les environnements Linux et Windows. SciTE est l'acronyme de Scintilla Text Editor, Scintilla étant une plateforme d'édition de texte qui propose par exemple des outils spécifiques pour corriger du code écrit avec SciTE

Critique de jedai
C'est vraiment une petite merveille, et tout léger, customisable à souhait, etc...
Pour ce qui est de la complétion du code et de l'aide en ligne pour Perl, il suffit de disposer du fichier d'API de Perl qui est disponible sur le site officiel et dans certaines distributions du soft pour Windows directement.

PerlEdit est un environnement de développement intégré pour Perl et un éditeur de texte généraliste. Il contient un éditeur de texte avec coloration syntaxique et un débogueur.

GNU/Emacs est un éditeur très polyvalent : édition de code, CVS, lecture d'email, édition d'image, etc. On peut mettre son code en ligne par FTP en appelant une simple commande (ou shortcut).

Pour l'édition du code, il possède de nombreux "modes" : C, C++, HTML, Java, qui vont adapter le fonctionnement d'Emacs. Il possède énormément de fonctions, couramment utilisées (en programmation ) : Recheche/remplacement (supporte les expressions régulières ), Indentation automatique du code (customisable), Coloration syntaxique, (Re)définition des raccourcis claviers "à chaud", Auto-complétion, Gestion du multifenêtrage, Permet de "cacher" le code d'une fonction (affiche uniquement la définition), gestion de macros et de scripts permettant ... Voir la suite

AutoDimer permet de développer les PCR multiplex et des dosages d'extension d'amorces

Perlprimer est un logiciel gratuit, open-source de l'application GUI écrit en Perl, qui conçoit des amorces pour la PCR standard, bisulfite PCR, PCR en temps réel (QPCR) et le séquençage. Il vise à automatiser et à simplifier le processus de conception d'amorces.

Easy to tranfert


Permet aussi de transférer un ou plusieurs fichiers entre deux machines Unix, avec une option de synchronisations des répertoires.

Permet d'envoyer un ou plusieurs fichiers, d'un ordinateur Windows vers Unix/Linux (comme WINSCP)

- Récupération des logs de tranferts à travers un STDOUT
- Connexion sécurisée
- Synchronisation à partir de la source (linux to linux)

NEdit, le "Nirvana editor", est un éditeur de code pour le système X Window. Il a une interface comparable aux éditeurs de texte sur Windows et Mac. Initiallement il a été développé par Mark Edel pour Fermilab sous une licence très restrictive, mais aujourd'hui il est distriblé sous licence GPL.

Jed est un éditeur de texte gratuit pour Unix, VMS, MSDOS, OS/2, BoOS, QNX et Windows9x/NT. Il est utile aussi bien pour écrire un simple email que pour éditer des programmes complexes dans de nombreux langages de programmation.

EPIC est un EDI open source pour Perl basé sur Eclipse, compatible avec Windows, Linux et Mac OS X. Que vous développiez des scripts CGI ou bien des gros projets Perl avec des centaines de modules, EPIC est l'EDI gratuit le plus puissant et le plus extensible.

Présentation de thierry.chich
Plein de fonctions (intégration de subversion, multilangage - php, c,etc., debugage intégré, template de module, ...). Il est aussi multiplateforme (linux, windows, mac).
Il est lourdingue et un peu lent
Il est difficile de le conseiller eclipse à un débutant je pense, ou alors il faut le former

Critique de Voir la suite

Kate est un éditeur de texte spécialement adapté à la programmation, fourni avec l'environnement de bureau KDE disponible pour les systèmes d'exploitation GNU/Linux, BSD et autres systèmes apparentés à Unix.