Codes sources Perl31 ressources dans cette catégorie

Les codes sources Perl téléchargeables. N'hésitez pas en rajouter.

Voici une procédure pour générer un timestamp au format DB2 c'est à dire au format : AAAA-MM-JJ HH:mm:ss.xxxxxx où les x représentent les microsecondes.

Il peut être utile de connaître le time d'une date, c'est l'inverse de time, localtime et gmtime. Cela se fait par exemple en php pour les connaisseurs via la fonction mktime. Comme d'habitude, il existe un module en Time::Local en perl déjà présent dans le CORE, donc pas besoin d'installation.

Ce module posséde deux méthodes timelocal et timegm qui renvoient le time. Il faut leur donner 6 informations sous forme de tableau ($sec,$min,$hour,$mday,$mon,$year).

Attention : $year sera bien l'année classique (avec + 1900), ex : 2007 et $mois sera compris entre 0 et 11 et non entre 1 et 12.

Nous trouver le time des dates 01/01/2000 et 05/12/2008



Vous pourrez maintenant jongler avec les tim ... Voir la suite

Comme DateTime est le module préconisé, mais qu'il n'est pas disponible dans le Core, alors que POSIX l'est, il me semble que c'est une bonne alternative pour des utilisations "limitées".

Le code ci-dessous est compatible avec des machines acceptant des entiers sur 32 bits. Il utilise mktime et localtime.

Attention toutefois sur les machines 32 bits, les dates limites utilisables sont de 1904 à 2038. Pour utiliser des dates en dehors de cette plage, il faut s'en remettre aux modules spécialisés comme DateTime.

Le code ci-dessous permet de convertir un fichier excel 2007 (ou antérieur) en fichier txt, csv ou autre fichier plat.

Le choix du séparateur est laissé à l'utilisateur.
Si l'on on précise un répertoire, le fichier convertit sera créé dans ce dernier, sinon, il sera créé dans le même répertoire que le fichier excel.
On peut choisir de convertir toutes les feuilles ou non du fichier excel en mettant -feuilles à 1 => tout sera convertit, ou à 0 et dans ce cas, à chaque feuille une confirmation sera demandée.

Attention : Nous avons utilisé ici la méthode print {$fh} $oWkC->Value, $Separateur;

Mais cette méthode peut nous générer des erreurs inattendues :
explication documentation o ... Voir la suite

Si vous souhaitez transposer un fichier tabulé, c'est à dire que les lignes de votre fichier deviennent des colonnes, voici une procédure qui peut vous aider.

Il y a 4 "e" dans $phrase

=()= est ce qu'on appelle en Perl un goatse, pas toujours connu du grand public.

En fait, c'est l'usage de l'opérateur d'affectation à une liste vide qui permet d'évaluer l'expression régulière dans un contexte de liste et dont le résultat est affecté à $count. Or la valeur de retour d'une affectation de liste évaluée dans un contexte de scalaire retourne le nombre d'élément contenu dans la rvalue de cet opérateur d'affectation, donc le nombre d'élément capturé par l'expression régulière.

Le module Bio::AlignIO permet de récupérer et d'analyser les séquences une à une en gardant les positions des gaps. On peut donc aussi récupérer un bloc de sous-séquences en gardant leur alignement, mais également obtenir la séquence consensuelle de cet alignement.

file.fsa

>A1/1-60
GATACCAGCGGGATCATTATGCCACATTCTGATCTTGGACCTGCATTATAGATCTGACTT
.
>A2/1-57
..TACCAGCGGGATCATTATGC.ACATTCTGATCTTGGACCTGCATTATAGATCTGACTT
.
>B1/1-55
GATACCAGCGGGATCATTATGCCACATTCTGATCTTGGACCTG....ATAGATCTGACT.
.
>C1/1-60
GATACCAGCGGGATCATTATGCCACATTCTGATCTTGGACCTGCATTATAGATCTGACTT
.
>C2/1-60
GATACCAGCGGGATCCTTATGCCACATTCTGATCTTGGACCTGCATTATAGATCTGACTT
.
>B2/1-61
GAT ... Voir la suite

Le but est de récupérer les identifiants et leur séquence une à une de façon simple et rapide grâce au module Bio::SeqIO. Fichier d'entrées :
test.txt

>A1
GATACCAGCATCGTACGTCGTACGTACGTAGGGATCATTATGCCACATTCTGATCTTGGACCTGCATTATAGATCTGACTT
>A2
TACCACCCGATCTCGCATCGTCATGTGCGGGATCATTATGCACATTCTGATCTTGGACCTGCATTATAGATCTGACTT
>B1
GATACCAGCGGGATCATTATGCCACATTCTGATCTTGGACCTGATAGATCTGACT
>B2
GATACCAGCCACTTCTGACGATCGATCGATATTATAAAAGGATCATTATGCCACATTCTGATCgTGGACCTGCATTATAGATCTGCCCTT
>C1
GATACCAGCGGGATCATTATGCCACATTCTGATCTTGGACCTGCATTATAGATCTGACTT
>C2
GATACCAGCGGGATCCTTATGCCACATTCTGATCTTGGACCTGCATTATAGATCTGACTT

Résultat

>A1
GATACCAGCATCGTACGTCGTACGTACGTAGGGA ... Voir la suite

Comment raboter un texte trop long et ajouter 3 petits points ?

Sous Linux ou Mac OS, il n'existe aucun utilitaire permettant de désinstaller un module Perl. Donc, voici un script qui peut vous permet de le faire proprement.

Pour faire un sleep de moins d'une seconde, il est recommandé d'utiliser le module Time::HiRes qui est disponible dans le core.
Mais vous pouvez être encore beaucoup plus précis. A vous de jouer avec ce module très puissant.